Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms