Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms