Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trim35Q8C006 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm44706-201ENSMUST00000206822 815 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Trim35Q8C006 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Trim35Q8C006 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim35Q8C006 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Scgb2b26-201ENSMUST00000085623 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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