Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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