Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp43Q8BUM9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp43Q8BUM9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms