Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc50Q810U5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc50Q810U5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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