Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ttc28Q80XJ3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ttc28Q80XJ3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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