Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Lrrc1Q80VQ1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Lrrc1Q80VQ1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Lrrc1Q80VQ1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms