Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pnma8aQ80VM8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms