Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms