Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rims3Q80U57 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rims3Q80U57 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms