Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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