Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Tnfsf18Q7TS55 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Tnfsf18Q7TS55 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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