Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shq1Q7TMX5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms