Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Eci3Q78JN3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Eci3Q78JN3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Eci3Q78JN3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Eci3Q78JN3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Eci3Q78JN3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Eci3Q78JN3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms