Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GypcQ78HU7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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