Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbf1Q6ZPE2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sbf1Q6ZPE2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms