Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp49Q6P9L4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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