Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smchd1Q6P5D8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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