Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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NipblQ6KCD5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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