Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gbf1Q6DFZ1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gbf1Q6DFZ1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbf1Q6DFZ1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbf1Q6DFZ1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbf1Q6DFZ1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbf1Q6DFZ1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbf1Q6DFZ1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gbf1Q6DFZ1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms