Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Jmjd1cQ69ZK6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Jmjd1cQ69ZK6 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Jmjd1cQ69ZK6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Jmjd1cQ69ZK6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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