Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pkp4Q68FH0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp4Q68FH0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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