Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ino80dQ66JY2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms