Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms