Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Top2bQ64511 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Top2bQ64511 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Top2bQ64511 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Top2bQ64511 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Top2bQ64511 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Top2bQ64511 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Top2bQ64511 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Top2bQ64511 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Top2bQ64511 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Top2bQ64511 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Top2bQ64511 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms