Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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