Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpd52Q62393 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpd52Q62393 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms