Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms