Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ecm1Q61508 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ecm1Q61508 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ecm1Q61508 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ecm1Q61508 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ecm1Q61508 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ecm1Q61508 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ecm1Q61508 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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