Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cln3Q61124 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms