Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp7Q60973 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbbp7Q60973 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms