Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms