Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem40Q4FJU9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem40Q4FJU9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem40Q4FJU9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem40Q4FJU9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem40Q4FJU9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem40Q4FJU9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem40Q4FJU9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem40Q4FJU9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms