Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shank3Q4ACU6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms