Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx25Q3ZT31 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms