Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2Q3V1H1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms