Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms