Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm6Q3UZD5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms