Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C87499Q3UX49 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms