Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ankrd13cQ3UX43 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ankrd13cQ3UX43 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms