Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms