Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms