Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms