Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b2Q3UJB0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms