Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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