Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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