Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.4 ms