Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atxn7l3bQ3UD01 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atxn7l3bQ3UD01 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atxn7l3bQ3UD01 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atxn7l3bQ3UD01 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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