Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk3Q3U3Q1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms